Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOBTB3O94955 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms