Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms