Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms