Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms