Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSNA1O43805 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SSNA1O43805 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SSNA1O43805 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SSNA1O43805 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSNA1O43805 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms