Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms