Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNMO15061 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNMO15061 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNMO15061 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNMO15061 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNMO15061 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNMO15061 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNMO15061 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNMO15061 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNMO15061 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNMO15061 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNMO15061 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNMO15061 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNMO15061 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNMO15061 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNMO15061 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNMO15061 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNMO15061 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNMO15061 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNMO15061 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNMO15061 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNMO15061 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNMO15061 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNMO15061 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNMO15061 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNMO15061 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNMO15061 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNMO15061 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNMO15061 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNMO15061 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNMO15061 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNMO15061 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNMO15061 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNMO15061 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNMO15061 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNMO15061 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNMO15061 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYNMO15061 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYNMO15061 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYNMO15061 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYNMO15061 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYNMO15061 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYNMO15061 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYNMO15061 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYNMO15061 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYNMO15061 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYNMO15061 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYNMO15061 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYNMO15061 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYNMO15061 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYNMO15061 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYNMO15061 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYNMO15061 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYNMO15061 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYNMO15061 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYNMO15061 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYNMO15061 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYNMO15061 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYNMO15061 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYNMO15061 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYNMO15061 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNMO15061 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNMO15061 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNMO15061 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNMO15061 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNMO15061 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNMO15061 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNMO15061 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNMO15061 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNMO15061 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNMO15061 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNMO15061 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNMO15061 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNMO15061 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNMO15061 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNMO15061 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNMO15061 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNMO15061 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNMO15061 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNMO15061 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNMO15061 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNMO15061 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNMO15061 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNMO15061 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNMO15061 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNMO15061 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNMO15061 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNMO15061 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNMO15061 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNMO15061 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNMO15061 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNMO15061 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNMO15061 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNMO15061 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNMO15061 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNMO15061 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNMO15061 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNMO15061 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNMO15061 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNMO15061 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms