Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms