Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXLO00592 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXLO00592 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXLO00592 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXLO00592 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXLO00592 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXLO00592 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXLO00592 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXLO00592 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXLO00592 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXLO00592 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXLO00592 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXLO00592 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXLO00592 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXLO00592 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXLO00592 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXLO00592 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXLO00592 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXLO00592 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXLO00592 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXLO00592 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXLO00592 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXLO00592 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXLO00592 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PODXLO00592 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXLO00592 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXLO00592 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXLO00592 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXLO00592 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXLO00592 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXLO00592 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXLO00592 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXLO00592 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXLO00592 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXLO00592 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXLO00592 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXLO00592 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXLO00592 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXLO00592 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXLO00592 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXLO00592 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXLO00592 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXLO00592 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXLO00592 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXLO00592 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXLO00592 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXLO00592 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXLO00592 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXLO00592 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXLO00592 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXLO00592 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXLO00592 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXLO00592 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXLO00592 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXLO00592 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXLO00592 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXLO00592 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXLO00592 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXLO00592 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXLO00592 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXLO00592 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXLO00592 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXLO00592 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXLO00592 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXLO00592 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXLO00592 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXLO00592 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXLO00592 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXLO00592 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXLO00592 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXLO00592 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXLO00592 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXLO00592 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXLO00592 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXLO00592 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXLO00592 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXLO00592 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXLO00592 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXLO00592 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXLO00592 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXLO00592 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXLO00592 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXLO00592 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXLO00592 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXLO00592 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXLO00592 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXLO00592 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXLO00592 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXLO00592 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXLO00592 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXLO00592 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXLO00592 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXLO00592 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXLO00592 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXLO00592 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXLO00592 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXLO00592 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXLO00592 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXLO00592 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXLO00592 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms