Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIEO00221 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms