Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DEV8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DEV8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DEV8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DEV8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DEV8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DEV8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DEV8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DEV8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DEV8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DEV8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DEV8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DEV8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DEV8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DEV8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DEV8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DEV8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DEV8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DEV8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DEV8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DEV8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DEV8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DEV8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DEV8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DEV8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DEV8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DEV8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DEV8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DEV8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DEV8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DEV8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DEV8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DEV8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DEV8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DEV8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DEV8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DEV8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DEV8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DEV8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DEV8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DEV8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DEV8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DEV8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms