Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO5BA8MYB1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5BA8MYB1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms