Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VGLL3A8MV65 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VGLL3A8MV65 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms