Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEURL1BA8MQ27 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms