Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOBPA7XYQ1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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