Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC162PA2VCL2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms