Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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