Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A4Q9Y6R1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms