Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G3

MRPL42, 39S ribosomal protein L42, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL42Q9Y6G3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL42Q9Y6G3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL42Q9Y6G3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL42Q9Y6G3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL42Q9Y6G3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL42Q9Y6G3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL42Q9Y6G3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL42Q9Y6G3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL42Q9Y6G3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL42Q9Y6G3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL42Q9Y6G3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MRPL42Q9Y6G3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL42Q9Y6G3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms