Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRRAPQ9Y4A5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms