Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHMP3Q9Y3E7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms