Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNQ9UQP3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNQ9UQP3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNQ9UQP3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNQ9UQP3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNQ9UQP3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNQ9UQP3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNQ9UQP3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNQ9UQP3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNQ9UQP3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNQ9UQP3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNQ9UQP3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNQ9UQP3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNQ9UQP3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNQ9UQP3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNQ9UQP3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNQ9UQP3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNQ9UQP3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNQ9UQP3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNQ9UQP3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNQ9UQP3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNQ9UQP3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNQ9UQP3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms