Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms