Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FZD1Q9UP38 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FZD1Q9UP38 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms