Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms