Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PADI3Q9ULW8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms