Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV5

HSF4, Heat shock factor protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF4Q9ULV5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSF4Q9ULV5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms