Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALD1Q9ULE6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms