Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DSEQ9UL01 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DSEQ9UL01 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DSEQ9UL01 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSEQ9UL01 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms