Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms