Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms