Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL42Q9P2K6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms