Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC88CQ9P219 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms