Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMG20BQ9P0W2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms