Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4Q9P0V3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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