Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMCD1Q9NZU5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms