Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR4AQ9NXH8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms