Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IMP3Q9NV31 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms