Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms