Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms