Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPCPD1Q9NPB8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPCPD1Q9NPB8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPCPD1Q9NPB8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPCPD1Q9NPB8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPCPD1Q9NPB8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPCPD1Q9NPB8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPCPD1Q9NPB8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPCPD1Q9NPB8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPCPD1Q9NPB8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPCPD1Q9NPB8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPCPD1Q9NPB8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPCPD1Q9NPB8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPCPD1Q9NPB8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPCPD1Q9NPB8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPCPD1Q9NPB8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPCPD1Q9NPB8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPCPD1Q9NPB8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPCPD1Q9NPB8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPCPD1Q9NPB8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPCPD1Q9NPB8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPCPD1Q9NPB8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms