Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTA1Q9NP79 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTA1Q9NP79 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTA1Q9NP79 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTA1Q9NP79 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTA1Q9NP79 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VTA1Q9NP79 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VTA1Q9NP79 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VTA1Q9NP79 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VTA1Q9NP79 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VTA1Q9NP79 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VTA1Q9NP79 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTA1Q9NP79 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms