Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAS3Q9H6U6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms