Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00597Q9H2U6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms