Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SENP6Q9GZR1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SENP6Q9GZR1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SENP6Q9GZR1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SENP6Q9GZR1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SENP6Q9GZR1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SENP6Q9GZR1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SENP6Q9GZR1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SENP6Q9GZR1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SENP6Q9GZR1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SENP6Q9GZR1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SENP6Q9GZR1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SENP6Q9GZR1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SENP6Q9GZR1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP6Q9GZR1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms