Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZV1

UBXN6, UBX domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6Q9BZV1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN6Q9BZV1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN6Q9BZV1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN6Q9BZV1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN6Q9BZV1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN6Q9BZV1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN6Q9BZV1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN6Q9BZV1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN6Q9BZV1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN6Q9BZV1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN6Q9BZV1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN6Q9BZV1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms