Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPF3BQ9BZI7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPF3BQ9BZI7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPF3BQ9BZI7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UPF3BQ9BZI7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms