Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRIP1Q9BX63 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms