Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP1Q9BWH6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP1Q9BWH6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms