Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms